La medicació no s'ha d'interrompre sense la supervisió d'un professional. Els antidepressius no es poden deixar de manera brusca, perquè poden aparèixer símptomes de retirada (ansietat, diarrea, somnis vívids).
Els antidepressius, a diferència d'altres fàrmacs, no generen la necessitat de prendre més dosi per tenir el mateix efecte (tolerància) ni la necessitat de consumir-los una un cop finalitzat el tractament (dependència).
Com tots els medicaments, els antidepressius poden tenir efectes adversos, que depenen del mecanisme d'acció de cada fàrmac i que solen millorar conforme avança el tractament.